تصویربرداری از حیوانات کوچک نقش مهمی در آنالیز فنوتیپ‌ها ، کشف دارو و درک پایه‌ای از مکانیسم‌های بیماری ایفا می‌کند. انتقال روش‌های تصویربرداری از انسان به حیوانات کوچک کار آسانی نیست.
تا به امروز، ترکیب برش‌زنی در بافت‌شناسی، رنگ‌آمیزی و ارزیابی میکروسکوپی برش‌های دوبعدی هنوز استاندارد طلایی برای آنالیز ساختار و ترکیب بافت‌های زیستی به حساب می‌آید.
