استاندارد طلایی پردازش داده‌های میکرو سی‌تی (μCT) پیش‌بالینی، هنوز ترسیم دستی نواحی و اندام‌ها به صورت کامل توسط متخصصان است. با این وجود، این روش زمان‌بر، مستعد خطا و دارای تکرارپذیری محدود است و بنابراین برای آنالیز دادهها در مقیاس بزرگ مناسب نیست. متأسفانه، هنوز الگوریتم‌های دقیق و قوی برای بخش‌بندی خودکار کل بدن وجود ندارد.
در این مقاله، به معرفی یک پایگاه داده پرداخته‌ایم که حاوی 225 اسکن سه‌بعدی میکرو سی‌تی از کل بدن موشها همراه با بخش‌بندی دستی اعضای بدن شامل مهم‌ترین اندام‌ها مانند قلب، کبد، ریه، نای، طحال، کلیه‌ها، معده، روده، مثانه، عضله‌ی ران، استخوان و تومورهای زیرپوستی است.
این پایگاه داده، شامل داده‌های میکرو سی‌تی با و بدون ماده کنتراست از طحال و کبد است. تمام اسکن‌ها همراه با بخش‌بندی اعضای بدن در سایت آنلاین Figshare به راحتی در دسترس است. ما، محققان را به استفاده‌ی دوباره از داده‌های ارائه‌شده تشویق می‌کنیم تا روش‌ها و الگوریتم‌ها را جهت بخش‌بندی خودکار و دقیق اندام‌ها ارزیابی کنند. این امر ممکن است بخش‌بندی دستی را کاهش داده و تکرارپذیری را افزایش دهد و حتی تعداد حیوانات آزمایشگاهی مورد نیاز را با کاهش منبع تنوع، و دسترسی به یک گروه مرجعِ قابل اعتماد کاهش دهد.
سگمنتیشن تعاملی ارگان‌ها با استفاده از داده‌های میکرو سی‌تی
.png)